Odkrivanje povojnih prikritih grobišč se je pričelo v 90-ih letih prejšnjega stoletja in do sedaj je evidentiranih več kot 700 grobišč. Muzej je od leta 2004 pridobil večje število civilnih in vojaških predmetov, ki so bili zbrani med ekshumacijami na dvaintridesetih lokacijah grobišč povojnih pobojev. Prvi zabeleženi predmeti v zbirki, ki šteje čez 3.500 predmetov, so iz grobišč Jama pod Macesnovo gorico in iz brezna Konfin 1. Kar 1705 predmetov je iz povojnega grobišča Cerklje ob Krki, kjer je potekal izkop jeseni 2013. Za enajstimi pregradami so v Hudi jami Barbara rov leta 2008 odkrili čez 1400 žrtev med katerimi so bili pripadniki slovenskega domobranstva, hrvaški domobrani, ustaši in civilisti. Predmeti najdeni v rovu v Hudi jami Barbara rov leta 2008 so bili skladno z odredbo preiskovalnega sodnika predani v Muzej.

Skrbnica  zbirke: dr. Monika Kokalj Kočevar, muzejska svetnica, e-mail: monika@muzej-nz.si

Molitvenik iz povojnega prikritega grobišča Huda jama.